《最终幻想X|X-2 HD重制版》游戏的故事背景设定在《最终幻想10》的故事结束两年之后。在“新”的威胁已经过去的世界开始新生活的尤娜，有一天在她得到的“球体”中找到了曾经和她一起旅行过的青年。随着“进入”的消失而消失的“他”可能存在于世界的某个地方。为了亲眼查明真相，尤娜与路克、派恩再次踏上了环游世界的旅程。